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コピーアンドペースト後のテキストファイルの列の配置の問題を解決するにはどうすればよいですか?

列7、8、および9をファイル1からファイル2の列7、8、および9にコピーして、新しいファイル3を作成しました。作成されたファイル(ファイル3)は元のファイルとして整列されていません。編集して、アラインメント?

私は次のコマンドを使用しました:

awk '(getline line < "file 1") > -1 {split(line,a); $7 = a[7]; $8 = a[8]; $9= a[9]} 1' file 2 > file 3

ファイル1:

GRM in vacuum

192700

1GRM     C1    1  17.188   0.311  13.994 -0.5971  0.0204 -0.0724
1GRM     C2    2   0.094   0.383   0.005  0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM     C3    3   0.091   0.524   0.008 -0.7098  0.3449 -0.3952

ファイル2:

GRM in vacuum

192760

1GRM     C1    1   0.061   0.071  14.000 
1GRM     C2    2   0.184   0.142  14.000
1GRM     C3    3   0.184   0.284   0.000

ファイル3(出力):

GRM in vacuum

192760

1GRM C1 1 0.061 0.071 14.000 -0.5971 0.0204 -0.0724
1GRM C2 2 0.184 0.142 14.000 0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM C3 3 0.184 0.284 0.000 -0.7098 0.3449 -0.3952

私が使用した位置合わせの問題を解決するために:

    awk 'BEGIN{fmt="%10s%9s%7d%8.3f%8.3f%8.3f%8.4f%8.4f%8.4f"} (getline line < "file 1") > -1 {n = split(line,a)} n > 6 {$0 = sprintf(fmt,$1,$2,$3,$4,$5,$6,a[7],a[8],a[9])} 1' "file 2" > file 3

しかし、それでも私には2つの問題があります。

最初の問題は、出力ファイルの列の配置が元のファイル(ファイル1とファイル2)とは異なることです。

2番目の問題は行10002で発生し、列2と3が組み合わされて、行10002から終わりまで出力ファイルの完全な列が消えます。以下は行10002の3つのファイルです。

ファイル1:

2500GRM     C3 9999  15.716   8.242   0.002  0.2372 -0.2989 -0.0758   # line 10001
2500GRM     C410000  15.592   8.311   0.003  0.2603 -0.2492 -0.2394   # line 10002
2501GRM     C110001  15.591   8.453   0.006  0.0887 -0.2458 -0.7014   # line 10003
2501GRM     C210002  15.714   8.524   0.007 -0.0788  0.0598 -0.9619   # line 10004

ファイル2:

2500GRM     C3 9999  15.433   8.378   0.000   # line 10001
2500GRM     C410000  15.310   8.449   0.000   # line 10002
2501GRM     C110001  15.310   8.591   0.000   # line 10003
2501GRM     C210002  15.433   8.662   0.000   # line 10004

ファイル3:

2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 0.2372 -0.2989 -0.0758   # line 10001
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000  -0.2492 -0.2394         # line 10002
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000  -0.2458 -0.7014         # line 10003
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000  0.0598 -0.9619          # line 10004

以下のリンクにあるすべてのファイルを添付しました。

https://drive.google.com/drive/folders/13diMVxlp-T9BXE_jnm_LL1jUPbz8eren

1

問題は、_file1_に8または9のデータフィールドがあり、_file2_に5または6のデータフィールドがあることです。 _C3 9999_が1つの不適切な形式のフィールドであるか、_C410000_が2つのフィールド_C4_と_10000_である必要があります。

できるフィールドの数に応じてフォーマットを調整するには

  • 2つのフォーマット文字列を使用して、それらを切り替えます
  • 行を分割して最後の3つの値を取得するときに配列要素の数をn保存します_a[n-2]_、_a[n-1]_、_a[n]_
_awk '
  BEGIN{
    fmt1="%8s %6s%5s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
    fmt2="%8s %11s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
  }
  (getline line < "file 1") > -1{
    n=split(line, a)
  }
  NF<=3{ print; next }                                                     # print original line 
  NF==6{ printf fmt1, $1, $2, $3, $4, $5, $6, a[n-2], a[n-1], a[n]; next } # 6 + 3 fields
  { printf fmt2, $1, $2, $3, $4, $5, a[n-2], a[n-1], a[n] }                # 5 + 3 fields
' "file 2" > "file 3"
_

出力:

_ ...
 2500GRM     C3 9999  15.433   8.378   0.000  0.2372 -0.2989 -0.0758
 2500GRM     C410000  15.310   8.449   0.000  0.2603 -0.2492 -0.2394
 2501GRM     C110001  15.310   8.591   0.000  0.0887 -0.2458 -0.7014
 2501GRM     C210002  15.433   8.662   0.000 -0.0788  0.0598 -0.9619
 ...
_
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Freddy