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Avogadro 1.2 ubuntu 16のインストールエラー。 CMAKEメイク

Ubuntu 16.4にAvogadro 1.2をインストールしようとしましたが、すべての手順に従い、不足している依存関係をすべてインストールし、コンパイル中に最終的にこのエラーが発生します：cmake ../およびインストールファイルの指示に従ってコマンドステップを作成します。

私は、githubの独自のサイトからavogadroの異なるバージョンを試しましたが、すべて同じエラーになります。私もeigen3を削除し、eigen2バージョンをインストールしましたが、同じ問題があります。

しかし、デフォルトのパッケージであるubuntu bionic bcozでは正常に動作します。 https://launchpad.net/ubuntu/+source/avogadro/1.2.0-4build1

だから誰かが上記のリンクからインストールする方法を教えてくれたり、以下のエラーを修正したりしたら、幸せです。

surya@surya-Inspiron-N5010:~/avogadro-master/build$ make
[  0%] Generating moc_elementcolor.cxx
Scanning dependencies of target elementcolor
[  0%] Building CXX object libavogadro/src/colors/CMakeFiles/elementcolor.dir/elementcolor.cpp.o
In file included from /usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/atom.h:33:0,
                 from /usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/mol.h:42,
                 from /home/surya/avogadro-master/libavogadro/src/colors/elementcolor.cpp:31:
/usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/base.h:287:68: warning: unused parameter ‘replaceNewlines’ [-Wunused-parameter]
       virtual const char  *GetTitle(bool UNUSED(replaceNewlines) = true) const { return "";}
                                                                    ^
[  1%] Building CXX object libavogadro/src/colors/CMakeFiles/elementcolor.dir/moc_elementcolor.cxx.o
[  1%] Linking CXX static library elementcolor.a
[  1%] Built target elementcolor
[  1%] Generating ui_bsdysettingswidget.h
[  1%] Generating moc_bsdyengine.cxx
Scanning dependencies of target bsdyengine
[  1%] Building CXX object libavogadro/src/engines/CMakeFiles/bsdyengine.dir/bsdyengine.cpp.o
In file included from /usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/atom.h:33:0,
                 from /usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/mol.h:42,
                 from /home/surya/avogadro-master/libavogadro/src/engines/bsdyengine.cpp:39:
/usr/local/include/openbabel-2.0/openbabel/base.h:287:68: warning: unused parameter ‘replaceNewlines’ [-Wunused-parameter]
       virtual const char  *GetTitle(bool UNUSED(replaceNewlines) = true) const { return "";}
                                                                    ^
[  1%] Building CXX object libavogadro/src/engines/CMakeFiles/bsdyengine.dir/moc_bsdyengine.cxx.o
In file included from /home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/include/avogadro/primitivelist.h:29:0,
                 from /home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/include/avogadro/engine.h:37,
                 from /home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/src/engines/../../../../libavogadro/src/engines/bsdyengine.h:29,
                 from /home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/src/engines/moc_bsdyengine.cxx:9:
/home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/include/avogadro/primitive.h:42:23: warning: ‘Avogadro::FALSE_ID’ defined but not used [-Wunused-variable]
   const unsigned long FALSE_ID = std::numeric_limits<unsigned long>::max();
                       ^
[  1%] Linking CXX static library bsdyengine.a
[  1%] Built target bsdyengine
[  1%] Generating qrc_navigatetool.cxx
[  1%] Generating moc_navigatetool.cxx
[  1%] Generating ui_navigatesettingswidget.h
Scanning dependencies of target navigatetool
[  2%] Building CXX object libavogadro/src/tools/CMakeFiles/navigatetool.dir/navigatetool.cpp.o
[  2%] Building CXX object libavogadro/src/tools/CMakeFiles/navigatetool.dir/eyecandy.cpp.o
In file included from /home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/include/avogadro/Painter.h:33:0,
                 from /home/surya/avogadro-master/libavogadro/src/tools/eyecandy.cpp:30:
/home/surya/avogadro-master/build/libavogadro/include/avogadro/primitive.h:42:23: warning: ‘Avogadro::FALSE_ID’ defined but not used [-Wunused-variable]
   const unsigned long FALSE_ID = std::numeric_limits<unsigned long>::max();
                       ^
[  2%] Building CXX object libavogadro/src/tools/CMakeFiles/navigatetool.dir/moc_navigatetool.cxx.o
[  2%] Building CXX object libavogadro/src/tools/CMakeFiles/navigatetool.dir/qrc_navigatetool.cxx.o
[  2%] Linking CXX static library navigatetool.a
[  2%] Built target navigatetool
[  2%] Generating libavogadro_sv.qm
lconvert: could not exec '/usr/lib/x86_64-linux-gnu/qt4/bin/lconvert': No such file or directory
libavogadro/src/CMakeFiles/avogadro.dir/build.make:486: recipe for target 'libavogadro/src/libavogadro_sv.qm' failed
make[2]: *** [libavogadro/src/libavogadro_sv.qm] Error 1
CMakeFiles/Makefile2:148: recipe for target 'libavogadro/src/CMakeFiles/avogadro.dir/all' failed
make[1]: *** [libavogadro/src/CMakeFiles/avogadro.dir/all] Error 2
Makefile:149: recipe for target 'all' failed
make: *** [all] Error 2
software-installationcompilingmake
2
user3241355

この回答の改訂版を参照 OpenBabel関数と関連する依存関係の問題により、Ubuntu 16.04 LTSで1.2バージョンがコンパイルされないことを確認できます。

したがって、 schroot メカニズムを使用することを検討します。既存の16.04 LTSシステム内に小さな18.04 LTSシステムが作成されます。どちらも同じファイルシステムを使用します。

schrootをセットアップするには、次のコマンドを実行する必要があります（コピーして貼り付けてください）：

Sudo apt-get install schroot debootstrap -y

cat <<EOF | Sudo tee /etc/schroot/chroot.d/bionic.conf
[bionic]
description=Ubuntu 18.04
directory=/srv/chroot/bionic
root-users=$USER
type=directory
users=$USER
EOF

Sudo mkdir -p /srv/chroot/bionic
Sudo debootstrap bionic /srv/chroot/bionic

cat <<EOF | Sudo tee /srv/chroot/bionic/etc/apt/sources.list
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu bionic main restricted universe multiverse
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu bionic-security main restricted universe multiverse
EOF

schroot -c bionic -u root apt-get update
schroot -c bionic -u root apt-get install avogadro

端末からAvogardo 1.2を実行するには、次を実行する必要があります。

schroot -c bionic env DISPLAY=:0.0 avogadro

必要に応じて、Avogadro.desktopファイルを作成してデスクトップに配置できます。

cat <<EOF > ~/Desktop/Avogadro.desktop
[Desktop Entry]
Version=1.2
Name=Avogadro
GenericName=Advanced molecular editor
Comment=Molecular Graphics and Modelling System
Exec=schroot -c bionic env DISPLAY=:0.0 avogadro
Icon=/srv/chroot/bionic/usr/share/pixmaps/avogadro-icon.png
Terminal=false
Type=Application
Categories=Qt;Science;Chemistry;Physics;Education;
StartupNotify=true
MimeType=chemical/x-cif;chemical/x-cml;chemical/x-daylight-smiles;chemical/x-gamess-input;chemical/x-gamess-output;chemical/x-gaussian-log;chemical/x-mopac-out;chemical/x-pdb;chemical/x-xyz;chemical/x-gaussian-checkpoint;chemical/x-gaussian-cube;chemical/x-qchem-output;
EOF

chmod +x ~/Desktop/Avogadro.desktop

そして、アプリケーションをお楽しみください：

Avogadro 1.2 on 16.04 LTS

1
N0rbert
walt@bat:~(1)$ apt-cache search lconvert
libv4l-0 - Collection of video4linux support libraries
libv4l-dev - Collection of video4linux support libraries (development files)
libv4lconvert0 - Video4linux frame format conversion library
qt4-dev-tools - Qt 4 development tools
addresses-goodies-for-gnustep - Personal Address Manager for GNUstep (Goodies)
walt@bat:~(0)$

これらのパッケージのいくつかをインストールする必要がありますか？

0
waltinator