これは非常に個人的な選択です（ファイルマネージャー/任意のプログラムがあなたの好みに最適です）が、PCMan-FM（LXDEから）は、デフォルトで秒以外のすべてを提供します。
しかし、変更する必要がありますか？
ThunarのFile Manager Preferences（Edit-> Preferences）に移動すると、DisplayタブプルダウンリストからDATE形式を選択できます。私の（x）Ubuntu 19.04システムには、秒を含む5つのオプションがあります（カスタムだけで、 5つのどれもニーズに合わない場合は、独自の構成を設定します）。
私は18.04 LTSボックスもテストしましたが、同じ5つのオプションがありました。Xubuntu18.04 LTSのthunarの構成ウィンドウの画像は
