VMDKファイルからファイルを抽出するコマンドラインツールはありますか? WinImageはそれを実行できるようですが、それはGUIのみです。
VMwareのディスクマウントユーティリティを使用してVMDKをマウントし、必要なファイルをコピーして、アンマウントします。
このページを参照してください: http://www.vladan.fr/mounting-your-vmdk-disks-directly-to-your-windows-box-how-to/
7Zip は、VMDKファイルを開いて抽出できます。コマンドラインバージョンを試すことができます。
フォルダーへの完全パス抽出で7Zipを使用します。
7z x -o<destination-folder> box-disk1.vmdk