以下を参照してください。
- http://technet.Microsoft.com/en-us/library/cc731188%28WS.10%29.aspx
- http://social.technet.Microsoft.com/wiki/contents/articles/migrating-active-directory-domain-controller-from-windows-server-2003-to-windows-server-2008.aspx
一言で言えば、新しいドメインコントローラー（DC、新しい2008 64ビットボックス）を追加し、ADを同期させてから、最後に古いサーバーを降格、登録解除、切断するのとまったく同じです。これは、複数のサーバーが使用可能であること、または少なくとも、既存のインフラストラクチャを危険にさらすことなく、1つを削除して2008で再インストールできる十分な数のDCが使用可能であることを前提としています。
2003サーバーが残っていない状態で移行した後は、ドメインとフォレストを2008 R2サーバー上にある場合でも、2003機能レベルで引き続き実行されるため、ドメインとフォレストを2008R2機能レベルにアップグレードすることを検討してください。
それ以外の場合、（単一の）サーバーのインプレースアップグレードを探している場合、これはアーキテクチャ間（32ビットから64ビットなど）ではサポートされていません。 （基本的に、これは32/64ビットの質問に対する唯一の懸念事項です-上記のいずれにも影響を与えないためです。）