「このテーマはデスクトップには適用できません。」
Windows 8.1では、これが完全にランダムにポップアップします。テーマは使いません。私もサービスを無効にしています。テーマサービスを有効または無効にしようとしましたが、修正されませんでした。これは完全にランダムな時間に発生し、原因を診断できません。
デスクトップで醜いテーマを有効にせずにこれを消音するにはどうすればよいですか？
これはどういうわけか破損した「同期テーマ」に関係していると思います。 Windowsを起動すると、テーマを同期しようとしますが、何らかの理由で同期できません（画像ファイルが見つからない可能性がありますか？）。その後、エラーが表示されます。
これは主に憶測です。
新しいテーマを作成してみて、それで問題が解決するかどうかを確認してください。最終的に、これが私にとって問題を解決したものです。