Xubuntu 18.04を使用しています。何をしたかわかりませんが、入力メソッド、uGet、トレイアイコン機能を備えたすべてのアプリケーションなど、すべてのアプリケーショントレイアイコンをタスクバーに表示できません。
この問題の正確な内部理由はわかりません。ただし、パネル設定GUIウィンドウを開きます。そして、「Xubuntu Bionic」として設定を復元すると、トレイアイコンが正しく表示されます。
パネルとタスクバーの問題の大部分は、デフォルト設定に戻すことで解決できます。