デスクトップまたはthunarのいずれかのフォルダーを右クリックすると、atomまたは実際には他のプログラム(画像/音楽/メディアプログラムなど)でフォルダーを開くオプションが必要です。これは、シナモン(問題があればArchで)とWindowsでかなり簡単にできました。
Thunarを開き、Editおよびカスタムアクションを設定します。
そこから、「Atomで開く」などの任意のオプションを追加できます。これがあなたが達成しようとしていることだと思いますか?